Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4E1Q9UPM8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4E1Q9UPM8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms