Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP18Q9UMW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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