Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO6Q9UM54 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO6Q9UM54 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms