Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DENND2AQ9ULE3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms