Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH9Q9ULB4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms