Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARDHQ9UL12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms