Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU6

TRHDE, Thyrotropin-releasing hormone-degrading ectoenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHDEQ9UKU6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHDEQ9UKU6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHDEQ9UKU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms