Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPATCH8Q9UKJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPATCH8Q9UKJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPATCH8Q9UKJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GPATCH8Q9UKJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GPATCH8Q9UKJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPATCH8Q9UKJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
GPATCH8Q9UKJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms