Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PILRAQ9UKJ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms