Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms