Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCP2D1Q9UJQ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms