Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL4Q9UJQ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms