Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms