Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms