Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IRD1Q9UHL9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms