Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms