Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHORDC1Q9UHD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms