Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms