Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTRF1LQ9UGC7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRF1LQ9UGC7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms