Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM8A1Q9UBU6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM8A1Q9UBU6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms