Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNAL1Q9UBT7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms