Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCHIP1Q9P0W5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms