Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMG20BQ9P0W2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms