Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINJ2Q9NZG7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINJ2Q9NZG7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms