Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR4Q9NYA4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms