Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPD3Q9NY59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms