Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPP4R2Q9NY27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP4R2Q9NY27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP4R2Q9NY27 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms