Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHBDL2Q9NX52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms