Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3EQ9NVU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms