Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PANK4Q9NVE7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PANK4Q9NVE7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms