Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF19AQ9NV58 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms