Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM140Q9NV12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms