Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC18Q9NUE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZDHHC18Q9NUE0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZDHHC18Q9NUE0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms