Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEPPQ9NTK1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEPPQ9NTK1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms