Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GKN1Q9NS71 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms