Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS45Q9NRW7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms