Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BIN3Q9NQY0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms