Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPHNQ9NQX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms