Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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CNGB3Q9NQW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGB3Q9NQW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB3Q9NQW8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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