Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms