Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPCPD1Q9NPB8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPCPD1Q9NPB8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms