Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms