Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUFT1Q9NNX1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms