Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms