Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms