Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKRIP1Q9H875 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms