Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSS3Q9H6R3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSS3Q9H6R3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms