Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FNDC4Q9H6D8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms