Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLMPQ9H6B4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLMPQ9H6B4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms