Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF3Q9H4W6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF3Q9H4W6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms